Льготы для НКО в сфере медицины

Медицинская деятельность НКО – жизненно важная сфера деятельности с особым регулированием. Она требует наличие специальной медицинской лицензии и подпадает под действие Федерального закона №323-ФЗ «Об основах охраны здоровья граждан в Российской Федерации». Российским налоговым законодательством для неё предусмотрен ряд льгот и привилегий. Например, некоторые медицинские услуги, оказываемые НКО, освобождены от НДС. А ряд некоммерческих организаций имеют право на льготы по налогу на прибыль. Однако такие налоговые преференции действуют исключительно при строгом соблюдении условий и норм, прописанных в Налоговом кодексе РФ и других НПА.

1. Льготы для медицинских НКО по НДС
2. Льготы для медицинских НКО по налогу на прибыль
3. Льготы по страховым взносам и другим налогам 

В самом начале нашей статьи отметим, что налоговыми льготами могут воспользоваться исключительно те медицинские некоммерческие организации, которые имеют специальную медицинскую лицензию (пп. 2 п. 2 ст. 149 НК РФ). Что касается так называемых «псевдомедицинских» НКО, занятых, например, иридодиагностикой, клеточной терапией, медицинской астрологией, применением «волшебных» жезлов, шаров и маятников, «снятием сглаза и порчи», телепатией, ясновидением и другой деятельностью, не имеющей научного обоснования и не признанной медицинской в научной её понимании, то ни о какой медицинской лицензии и налоговых льготах не может идти и речи. 

Не имеют право на получение медицинской лицензии и налоговых льгот и некоммерческие организации, занятые так называемой «народной медициной» (традиционной или альтернативной) – комплексом практик оздоровления, накопленных народом и передаваемых из поколения в поколение, используемых для диагностики и лечения различных болезней (лечение травами, настоями, отварами, средствами животного и минерального происхождения, различными «самодельными» порошками и мазями, прогреванием и пр.).  Нужно отметить, что таким организациям требуется так называемое Разрешение на занятие традиционной народной медициной. Однако права получить полноценную медицинскую лицензию данные организации лишены.

Хотя нередко некоторые «народно-медицинские» НКО пытаются отчаянно «доказать» медицинский характер своей детальности и «заполучить» медицинскую лицензию. Так,  в ноябре 2025 года одна из медицинских автономных некоммерческих организаций города Пскова,  занятая так называемой традиционной «народной медициной», пыталась доказать в Арбитражном суде региона неправомерность отказа ей региональной службы Росздравнадзора в выдаче медицинской лицензии. Причём в организации трудились профессиональные медики с медицинскими дипломами. Однако иск АНО к территориальному органу Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения по Псковской области в рамках Дела № А43-53147/2025 остался не удовлетворённым. Вместе с тем нужно признать, что использование методов традиционной «народной медицины» допускаются даже в лечебно-профилактических учреждениях государственной и муниципальной системы здравоохранения. 

Льготы для медицинских НКО по НДС

Нужно сказать, что льготы по данному налогу действуют отнюдь не ко всем без исключения медицинским услугам, оказываемым гражданам медицинскими НКО. 

В соответствии со статьёй 149 Налогового кодекса РФ, от уплаты НДС освобождены: 

• все услуги, предоставляемые в рамках обязательного медицинского страхования (ОМС);
• услуги гражданам по диагностике, профилактике и лечению заболеваний (полный перечень прописан в Постановлении Правительства РФ № 132 от 20 февраля 2001 года); 
• сбор крови её компонентов для медицинских целей;
• скорая медицинская помощь (услуги медицинской помощи, оказываемой гражданам при заболеваниях, несчастных случаях, травмах, отравлениях и других состояниях, требующих срочного медицинского вмешательства);
• дежурство медперсонала у постели больного (круглосуточное наблюдение, уход и контроль за состоянием больного, которые осуществляются в соответствии с утверждённым графиком работы медицинского учреждения);
• патологоанатомические услуги (исследования, направленные на изучение патологических изменений в организме больного, определения диагноза заболевания, выбор тактики лечения или установление причины смерти);

• все медицинские услуги для беременных, новорожденных, инвалидов и наркологических больных; 
• санитарно-эпидемиологические услуги (мероприятия направленные на обеспечение санитарно-эпидемиологического благополучия граждан);
• деятельность аптек и аптечных пунктов при реализации жизненно важных лекарственных препаратов и средств;
• изготовление лекарственных препаратов аптечными сетями, имеющими лицензию на фармацевтическую деятельность (кроме БАДов);
• изготовление и ремонт очков для слепых;
• изготовление и ремонт слуховых аппаратов для глухих;
• протезно-ортопедическая помощь (диагностика больных, подготовка к протезированию, изготовление, ремонт и техническое обслуживание протезно-ортопедических изделий);
• медицинская реабилитация;
• санаторно-курортное лечение. 

Позвонить

Оставить заявку

Оставьте Телефон, логин Telegram или E-mail и мы свяжемся с вами!

Важно отметить, что в выше представленный перечень входят и ветеринарные услуги  (предупреждение и лечение болезней животных). Однако тут, наверное, речь идёт уже больше не о деятельности медицинских НКО, а о деятельности  зоозащитных НКО, о которых мы расскажем в другой нашей статье. 

Также отметим, что  в услугу скорой медицинской помощи не входят услуги по аренде автомобилей скорой медпомощи и предоставления водительского персонала для выездных бригад скорой помощи. Данные услуги облагаются НДС в общем порядке (Письмо ФНС № ЗГ-2-3/1882@ от 30.10.2020). Хотя нередко от НКО, занятых предоставлением автомобилей скорой медпомощи и водительского персонала, к нам поступает множество вопросов по поводу применения к их услугам льгот по НДС.

Вопросы по поводу применения льгот по НДС поступают и от многочисленных НКО, занятых так называемой косметологией – предоставлением различных косметических услуг (механическое, физическое и химическое воздействие на тело и кожу тела с использованием средств декоративной косметики, с целью эстетического улучшения внешности и омоложения). Ключевое слово тут: «эстетическое улучшение и омоложение». То есть не с целью оздоровления, а с целью эстетического улучшения и омоложения. Такие НКО не имеют права на предоставления им льгот по НДС. 

Если же речь идёт о медицинской косметологии (механическое, физическое и химическое воздействие на тело и кожу тела с целью оздоровления) то в соответствии с  Письмом российского Минфина № 03-07-07/55910 от 26 июля 2019 года и Письмом ФНС № ГД-4-3/4474@ от 20 марта 2015 года данные услуги под освобождение от НДС полностью подпадают. 

Тут ещё важно уделить внимание самой терминологии, что приводит к некоторой путаницы: 

Косметические услуги (эстетическая косметология) – это бытовые услуги, направленные на уход за телом и кожей, а также коррекцию внешности с использованием средств декоративной косметики с целью эстетического улучшения внешности и омоложения.

Косметологические услуги (медицинская косметология) – это медицинские услуги, которые включают комплекс лечебно-диагностических и реабилитационных мероприятий, направленных на сохранение или восстановление структурной целостности и функциональной активности покровных тканей организма

Для того чтобы минимизировать риски возникновения споров с ФНС по поводу применения льготы по НДС по косметологическим услугам мы рекомендуем руководствоваться: 

• Письмом Минфина № 03-07-07/77 от 25 ноября 2011 года; 
• Приказом Министерства здравоохранения и социального развития № 381н от 18 апреля 2012 года;
• Приказом Министерства труда № 1069н от 22 декабря 2014 года и другими НПА. 

Если в перечне, прописанном в ст. 149 НК РФ, есть какие-либо услуги, предоставляемые вашей НКО, вы, подав уведомление в ФНС, можете воспользоваться налоговой льготой по НДС. 

Льготы для медицинских НКО по налогу на прибыль

Медицинские НКО вправе воспользоваться и специальными условиями при расчёте налога на прибыль и применять так называемую льготную ставку 0 % по налогу на прибыль организаций. Однако эта преференция доступна не для всех медицинских некоммерческих организаций. Для того чтобы воспользоваться льготой, нужно соблюсти ряд условий, прописанных в статье 284.1 Налогового кодекса РФ. 

Условия для нулевой ставки по налогу на прибыль:

• Вид деятельности НКО обязательно должен входить в Перечень видов медицинской деятельности, который прописан и утверждён Постановлением Правительства РФ № 917 от 10 ноября 2011 года; 
• Доходы НКО от медицинской деятельности за календарный год должны составлять не менее 90 % всех доходов либо доходов, облагаемых налогом на прибыль; 
• Штат организации должен насчитывать не менее 15 работников по ТД. При этом штатная численность медицинского персонала, имеющего сертификат специалиста-медика или свидетельство об аккредитации специалиста-медика, должна быть не менее 50 % от общего числа работников медицинского учреждения. Это правило нужно соблюдать непрерывно в течение года;
• В налоговом периоде, в котором применяется нулевая ставка, не должно быть операций с векселями и финансовыми инструментами срочных сделок.

Суммировать доход, подпадающий под льготу по НП, не допускается! Например, некая некоммерческая организация занимается медицинской деятельностью. Параллельно с этим она ещё ведёт и так называемую медицинскую образовательную деятельность – обучение и повышение квалификации медицинских и фармацевтических работников (в соответствии с ст. 284.1 НК РФ на образовательную деятельности  также предусмотрена льгота по налогу на прибыль). Даже если совокупный доход от этих двух видов деятельности составляет 90% в общей доле налогооблагаемых доходов НКО, однако по каждому из них по отдельности – менее 90%, то право на льготу по НП такая организация иметь не будет. Как ни парадоксально, но это так! (Письмо Минфина РФ от 17 июля 2015 г. № 03-03-10/41223). 

Также отметим, что округлять долю доходов в большую строну не допускается. Даже если доля доходов НКО от медицинской деятельности в календарном году составит 89,99%, она всё же не будет иметь право на льготу по НП. (Письмо Минфина РФ от 23 мая 2012 г. № 03-03-06/4/46).

Вместе с тем, в соответствии с Письмом УФНС РФ по г. Москве от 20 июня 2012 г. № 16-15/053964@, невыполнение условия о доле доходов от медицинской деятельности по итогам отчётных периодов (квартала, полугодия, 9 месяцев) не влияет на право использования льготная ставка 0% по НП. Оно имеет значение только по итогам года. 

Для того чтобы НКО начать применять нулевую ставку по НП, в ФНС необходимо подать заявление с приложением копии медицинской лицензии. Заявлении необходимо подать не позднее чем за 1 месяц до начала налогового периода, в котором будет применяться льготная ставка 0%. 

Если же НКО в налоговом периоде уже применяла льготную ставку 0% по НП, то до 25 марта следующего года организация  должна подтвердить своё право на льготу в ФНС. Для этого необходимо подать сведения о доле доходов от осуществления медицинской деятельности в общей сумме доходов, о численности работников НКО, а также медицинского персонала, который имеет сертификат специалиста-медика или свидетельство об аккредитации (форма КНД 1150022). Если организация этого не сделает, то с начала года налог на прибыль нужно восстановить по общей ставке (письмо Минфина от 13 мая 2024 г. № 03-03-06/1/43267). Кроме того, придётся ещё и заплатить пени. 

Медицинские НКО, применявшие льготную налоговую ставку 0% по НП и перешедшие на применение ставки 25%, в том числе по причине несоблюдения обязательных требований и условий, не вправе повторно перейти на применение льготной ставки в течение 5 лет, начиная с налогового периода, когда они перешли на применение стандартной ставки 25%.

Льготы по страховым взносам и другим налогам 

По общему правилу, стандартный тариф страховых взносов для всех организаций составляет – 30%. Однако для так называемых социально ориентированных НКО, в том числе медицинских, всё ещё доступна пониженная ставка в 7,6%. По словам юриста «Партнёр НКО» Галины Клименко, такая преференция действует до 2026 года включительно. Впрочем не исключено, что её сохранять. Чтобы её получить, необходимо соблюсти два условия:

• Осуществлять социально значимую деятельность. Медицинская деятельность НКО таковой является;
• Не менее 70% доходов НКО должны составлять целевые поступления (гранты, субсидии, пожертвования) и выручка от льготных видов деятельности.

Что касается других налогов, для медицинских НКО может также быть предусмотрен ряд льгот по налогу на имущество, земельному и транспортному налогам. Однако установления таких льгот находится исключительно в ведении субъектов Российской Федерации и муниципалитетов. Так, например, гл. 28 НК РФ, устанавливая ставки по транспортному налогу в п. 1 ст. 361 НК РФ, в п. 2 ст. 362 НК РФ указывает, что их значение может меняться субъектами Российской Федерации в большую или меньшую сторону в 10 раз. А в законе г. Москвы «О транспортном налоге» от 9 июля 2008 № 33 закреплены окончательные требования по исчислению налога, в частности, ставки, используемые для расчёта транспортного налога для различных субъектов.

---

Остались вопросы?

Пишите или звоните: +7 (495) 004-02-10

Академия НКО — образование руководителей и команды от «Партнёр НКО».
Вебинары НКО — 25 часов, с онлайн разбором ваших кейсов.
Конференция НКО — Общероссийский форум по развитию НКО.
Форум НКО — крупнейшее сообщество НКО в России.

---